Огромные заслуги А.С. Емельянова отмечены двумя орденами Ленина (1936 г., 1966 г.), двумя серебряными и золотой медалями ВДНХ (1939 г., 1954 г., 1965 г.), медалью за доблестный труд в Великой Отечественной войне (1945 г.), присвоено звание «Заслуженный зоотехник РСФСР» (1950 г.), награжден Почетной грамотой ВАСХНИЛ (1939 г.), Почетной грамотой Президиума Верховного совета РСФСР (1961 г.), дипломом почета ВДНХ (1966 г.), юбилейной медалью «За доблестный труд» в честь 100-летия со дня рождения В.И. Ленина (1970 г.), орденом Октябрьской революции (1971 г.). В 1970 году ректорат Вологодского молочного института принял решение о занесении А.С. Емельянова в «Книгу трудовой славы ВМИ».
СЗНИИМЛПХ в настоящее время сохраняет традиции, заложенные одним из выдающихся ученых России Емельяновым А.С. и укрепляет их новыми подходами и методами исследований по совершенствованию молочных пород крупного рогатого скота, внедрением современных технологий в области растениеводства, кормопроизводства и кормления животных.
В честь памяти выдающегося ученого в с. Молочное названа улица Емельянова А.С., а в вестибюле СЗНИИМЛПХ установлен его барельеф.
24 февраля 2021 г. в СЗНИИМЛПХ состоится День памяти Алексея Степановича Емельянова
РЕГЛАМЕНТ проведения Дня памяти А.С. Емельянова
Место проведения: с. Молочное, ул. Ленина, д. 14, СЗНИИМЛПХ
Время проведения: 10:00 – 12:00
Участники: сотрудники СЗНИИМЛПХ, приглашенные ветераны, студенты ВГМХА им. Н.В. Верещагина
